Marie Foegh har tidligere været ansat på førende gynækologiske afdelinger i hovedstadsområdet, hvor hun blandt andet har fungeret som reservelæge på Rigshospitalet, gynækologisk obstetrisk afdeling, og 1. reservelæge på Herlev, gynækologisk obstetrisk afdeling. Efterfølgende har hun været Associate Professor, Division of Transplantation på det anerkendte Georgetown University Hospital i Washington D.C. i USA, med ansvar for organ transplantation og forskning i østrogens effekt på immunsystemet.
Gennem sin karriere har Marie Foegh beklædt flere nationale og internationale lektorater og gæsteprofessorater. Marie Foegh har udgivet mere end 150 videnskabelige artikler og skrevet mere end 40 bogkapitler inklusive lærebogskapitler.
Marie Foegh brænder for kvinders sundhed og hun har været fortaler for flere initiativer inden for dette område.